Οι υποψήφιοι πρέπει να κρατούν νερό, ένα στυλό και το μουσικό τους όργανο (προαιρετικά για τη Β'Γυμνασίου).
Η μεταφορά των μαθητών γίνεται δωρεάν με τα ΚΤΕΛ. Τα δρομολόγια διαμορφώνονται αναλόγως κάθε χρονιά.
Μαθητές που φοιτούν ήδη στα γενικά Γυμνάσια και Λύκεια και επιθυμούν να μετεγγραφούν και να φοιτήσουν στο Μουσικό Σχολείο Ηρακλείου, έχουν την δυνατότητα να το κάνουν μέσω των κατατακτηρίων εξετάσεων.
Η ακριβής ημερομηνία των κατατακτηρίων και οι ελεύθερες θέσεις για κάθε τάξη, ανακοινώνονται από το Σχολείο στις αρχές Σεπτεμβρίου.
Στις εξετάσεις αυτές λαμβάνουν μέρος αποκλειστικά μαθητές που έχουν φοιτήσει σε άλλο Γυμνάσιο ή Λύκειο και όχι οι απόφοιτοι του Δημοτικού. Οι απόφοιτοι του Δημοτικού εισάγονται μόνο με τις εξετάσεις επιλογής τον Ιούνιο κάθε έτους, στην Α'Γυνασίου. Όσοι απόφοιτοι του Δημοτικού έχασαν την προθεσμία του Ιουνίου, δεν μπορούν να δώσουν κατατακτήριες εξετάσεις τον Σεπτέμβριο, παρά μόνο όταν θα έχουν τελειώσει την Α'Γυμνασίου στο γενικό Γυμνάσιο.
Οι κατατακτήριες εξετάσεις διεξάγονται στο Μουσικό Σχολείο Ηρακλείου κατά το τρίτο 10/ ήμερο του Σεπτεμβρίου κάθε χρόνο, εφόσον υπάρχουν ελεύθερες θέσεις.
Η εξεταστέα ύλη των κατατακτηρίων εξετάσεων προέρχεται κάθε φορά από τη διδαχθείσα ύλη του αμέσως προηγούμενου σχολικού έτους και ανακοινώνεται με τη λήξη του διδακτικού έτους.
Η αξιολόγηση της επίδοσης των υποψηφίων σε κάθε ένα από τα εξεταζόμενα μαθήματα γίνεται στην εικοσάβαθμη βαθμολογική κλίμακα. Τα σκέλη μαθημάτων αξιολογούνται χωριστά στην εικοσάβαθμη κλίμακα. Ο μέσος όρος (Μ.Ο.) των δύο επιμέρους βαθμών αποτελεί τον τελικό βαθμό κάθε μαθήματος. Επιτυχόντες είναι όσοι έχουν συγκεντρώσει τουλάχιστον τη βαθμολογική βάση δέκα (10) σε κάθε εξεταζόμενο μάθημα.
Κάθε υποψήφιος οφείλει να γνωρίζει τον Αριθμό Πρωτοκόλλου της Αίτησής του, που είναι και ο κωδικός υποψηφίου. Μετά τη τελευταία μέρα των εξετάσεων, τα αποτελέσματα αναρτώνται στο Σχολείο. Στην αναρτημένη λίστα, λόγω προσωπικών δεδομένων, δεν αναγράφονται ονόματα αλλά ο κωδικός υποψηφίου και το αποτέλεσμα. Επιπλέον, κάθε υποψήφιος ενημερώνεται με ατομικό email.
Για κάθε επιτυχόντα το σχολείο συντάσσει δελτίο μετεγγραφής, το οποίο θα παραλάβει ο γονέας/κηδεμόνας και θα το παραδώσει στο Γυμνάσιο ή Λύκειο φοίτησης, για την ολοκλήρωση της μετεγγραφής. Οι μετεγγραφές των μαθητών που κατατάχθηκαν γίνονται σύμφωνα με τις ισχύουσες διαδικασίες εντός πέντε (05) ημερών από την έκδοση των αποτελεσμάτων.